Ein bedeutender Bestand ist die Sammlung zum Schwerpunktthema Schiffbau und Werften. Hier wird nicht nur die Geschichte der einzelnen Werften der Region dokumentiert, sondern auch die Entwicklung des Schiffbaus an der Wesermündung. Schiffbauwerkzeug verschiedener Berufe und Zeiten sowie komplette Arbeitsplätze aus dem Schiffbau sind vertreten. Besonders anschaulich und dokumentarisch wertvoll sind die Modelle der einheimischen Werften.
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